The Seed of the World Tree II

Yuuji nimmt den Job an, den JB ihm gegeben hat, aber nur, damit er sie beschützen kann. Dazu verlassen er und Makina die Akademie, um ein bewegliches Ziel zu präsentieren und Sachi überreicht Makina zum Abschied einen Apfelbäumchen. Die Bemühungen der Organisation, Makina zu erwischen, sind erfolglos, da Yuuji jeden nach ihnen geschickten Agenten entsorgen kann. Als sie fliehen, wird Yuuji auf Makinas wiederkehrende Albträume aufmerksam, die ihren Vater betreffen. Es wird enthüllt, dass Makinas Vater einige Jahre zuvor Beweise für die Korruption der Irisu-Gruppe gefunden und auf Befehl seiner Frau vor den Augen von Makina getötet wurde. Makina verbrachte mehrere Jahre in einem Krankenhaus, um sich von dem Trauma zu erholen. Es wird weiter enthüllt, dass sie ein nahezu fotografisches Gedächtnis hat und einige der belastenden Dokumente vor dem Tod ihres Vaters gelesen hatte. Es stellt sich heraus, dass Makina's Mutter ordnete den Schlag gegen Makina an, weil sie ihre Mutter anrief und drohte, die Korruption aufzudecken, es sei denn, ihre jüngere Schwester würde in Sicherheit gebracht. Als ihr neuestes Versteck kompromittiert wird, schafft es Yuuji, sie wegzubekommen, aber Makina vergisst ihren Bäumchen. Trotz Yuujis Ermahnung, es zu vergessen, kehrt Makina zum Hotel zurück, um danach zu suchen und wird erschossen. Yuuji taucht rechtzeitig auf, um sie in ein Krankenhaus zu bringen, wird aber von JB abgefangen. Im Krankenhaus taucht Makinas Mutter auf und fragt zu JBs Entsetzen und Abscheu, ob Makinas innere Organe unversehrt sind, da Sarina eine Organtransplantation benötigt. Später taucht ein verkleideter Yuuji im Hauptquartier der Irisu-Gruppe auf und erschießt Makinas Mutter. Mit dem Auftragnehmer für den Hit aus dem Bild und mit stichhaltigen Beweisen für die Korruption der Irisu-Gruppe in den Händen der Organisation,Yuuji und eine sich erholende Makina kehren zur Akademie zurück.